根据《医疗事故处理条例》第四十六条规定，处理医疗纠纷的程序是：
1、医患沟通：加强与患方的沟通，消除误会、化解矛盾；
2、调解：医患双方通过沟通，遵循合法、合理、自愿的原则达成一致和解意见并签订协议书；
3、第三方调解，卫生行政部门来进行行政调解；
4、如果医疗纠纷不能成功调解，那么可以进行司法鉴定。
法律依据
《医疗事故处理条例》第四十六条